Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调控实时全景图

东京大学的资料分析技术人员和RIKEN Research资料分析所的同事们却是曾创设了首个针对自身免疫反应性性疾病和自身呼吸道性性疾病的遗传物质资料库。想要这一水资源能为免疫反应性疾病的转变提供最初见解，并也许有助于抑制剂的发现。发现者们还想要，与免疫反应具体的遗传物质组资料图问道最终也许应用于诸如COVID-19等狂犬病的资料分析。

东京大学项目资料分析秘书，临床风湿病学家，功用遗传物质组学医学专家Mineto Ota博士问道：“要了解性疾病，就必须深刻解读遗传物质人体内的功用。有了这个资料集，我们就可以将与性疾病具体的DNA核苷酸变化的资料与对性疾病发病机制极为举足轻重的遗传物质和蛋白质各种类型联系上来。”Ota是该团队发表在《Cell》月刊上的撰文的主要写作者，撰文标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的发现者们共同来进行的。

写作者写道，免疫反应酪氨酸的性疾病（IMD）都有从自身免疫反应性到自身呼吸道的多种病变。他们指借助于，尽管IMD中会炎性蛋白质因子的诱发活动表明免疫反应蛋白质功用发生了变化，但是，“对于IMD的具体遗传物质甚至具体蛋白质各种类型知之甚少。”

均遗传物质组关连资料分析（GWAS）发现了许多与IMD具体的遗传物质组位点。但是，在此类关连资料分析中会鉴定借助于的许多遗传物质人体内都地出口处调节遗传物质“on”或“off”解读的DNA非编码器区外，而不是地出口处遗传物质编码器核苷酸中会。资料分析工作小组指借助于：“GWAS却是曾阐释了许多与复杂表型和性疾病具体的遗传物质组位点，都有IMD。这些人体内中会的大多数都地出口处非编码器遗传物质组区外，偏爱是抑制元件，如增强子和启动子。”

为了阐释抑制DNA的功用，一种完全相同各种类型的遗传物质组分析，称为解读定量表型遗传物质位点（eQTL），有助于将DNA核苷酸的差异与遗传物质解读的差异联系上来。利用eQTL资料，资料分析技术人员可以对抑制DNA核苷酸的目的、抑制核苷酸中会的人体内如何影响其抑制遗传物质的解读以及这些遗传物质解读差异如何导致性疾病做借助于越来越明智的猜测。

其它针对免疫反应的eQTL资料分析却是曾在来进行中会，但先前的资料分析工作只都有生活品质志愿者，并检查了实际数量的蛋白质各种类型。资料分析技术人员写道：“对生活品质小分子免疫反应蛋白质的资料分析也许无法捕获性疾病长时间下发现的一系列eQTL效应。此外，虽然对免疫反应蛋白质的最初刺激可以在某种程度上模拟性疾病长时间，但却是平常揭示借助于体内的生物体环境。”

Ota补充道：“炎病患态下，免疫反应蛋白质的物理功用与生活品质长时间下的相同蛋白质截然完全相同。与免疫反应持续性具体的遗传物质人体内也许只在患病长时间下起作用，因此对于这种各种类型的遗传物质资料分析，从单纯病患身上获取样本极为举足轻重。”

在他们最近媒体报道的资料分析中会，资料分析工作小组对79名生活品质志愿者和337名被病患患有10种完全相同各种类型免疫反应酪氨酸性疾病（都有类风湿性关节炎、系统性狼疮和系统性乳腺癌）的病患来进行了均遗传物质组高通量。所有志愿者都是欧美后代。

了解免疫反应酪氨酸的性疾病不具挑战性，因为尽管每种性疾病在临床上都是完全相同的，但仍有许多重叠之出口处，并且不具相同病患的病患也许会表现借助于极为完全相同的病患。资料分析技术人员补充问道：“由于所有这些生态系统，一次学习一种免疫反应酪氨酸性疾病的能力是实际的。但是，如果我们一起资料分析10种性疾病，就可以越来越均面地了解这些各种类型的性疾病。”

在完毕均遗传物质组高通量后，资料分析技术人员从志愿者的体液样本中会分离借助于28种完全相同各种类型的免疫反应具体蛋白质，并探测了这些蛋白质中会的遗传物质解读。“我们在图问道中会看到，每种免疫反应蛋白质各种类型都有完全相同的eQTL结果，这可以告诉我们蛋白质各种类型密切关系遗传物质抑制的差异，以及哪种蛋白质各种类型对于转变哪种性疾病至关举足轻重。”资料分析技术人员问道。

写作者报告问道，“在遗传物质解读分析中会，我们在一个平台上对多个IMD来进行尤其，使我们尽也许描述每个性疾病（病患）的特征，并辨别与单个性疾病特异性具体的遗传物质，以及在一组IMD中会失调的通道……我们的资料集使我们尽也许检测每个特定蛋白质各种类型中会eQTL效应的生物体（性疾病）背景驱动的干扰。”

资料分析技术人员将给与的水资源命名为东京大学免疫反应蛋白质遗传物质解读图问道（ImmuNexUT），并问道它代表了使用东亚后代志愿者创设的最大的eQTL资料集。他们总结道：“我们确定了免疫反应蛋白质各种类型特异性的eQTL效应，都有以前不曾媒体报道的罕见蛋白质各种类型，它们在生物体呼吸道条件下的生态系统，以及这些eQTL与IMD遗传密切关系的显著关连。”

“到现阶段，在这一领域，大规模的遗传物质组和功用遗传物质组资料分析主要是利用欧洲地区捐**来进行的，尽管群体生态系统对于精确解读遗传物质组功用至关举足轻重。”资料分析技术人员问道，“这个欧美受试者的eQTL图问道对于克服这种以欧洲地区为中会心的偏见，为基础欧洲地区的资料集全面资料分析DNA人体内的功用，也不具举足轻重涵义。”

资料分析技术人员想要ImmuNexUT资料库将继续上升，并最终为病患造就越来越好的结果。他们问道：“与之后媒体报道的水资源相比，我们的资料集不具独特而有利于的特点，都有均面的免疫反应蛋白质细分、捐**密切关系免疫反应持续性的变化以及表征的非欧洲地区捐**。”